۴ ـ إجازته للشيخ رشيد الدين بن إبراهيم الأصفهاني . مختصرة ، تاريخها تاسع جمادى الأُولى سنة (۹۷۱ ه ) ، كتبها له بالمشهد الرضوي .
۵ ـ إجازته لولديه الشيخ بهاء الدين محمّد ، والشيخ أبي تراب عبد الصمد . مختصرة ، كتبها لهما بالمشهد الرضوي ثاني رجب سنة (۹۷۱ ه ) .
۶ ـ إجازته للسيّد علاء الدين محمّد بن هداية اللّه الحسيني الخيروي . تاريخها سنة (۹۶۷ ه ) ، مختصرة ، وهي بخطّ المجاز على ظهر كتاب النصوص .
۷ ـ إجازته للمولى ملك علي . متوسطة ، روى فيها عن السيّد حسن بن جعفر والشهيد الثاني كليهما عن الشيخ علي الميسي ، ولعلّ المجاز والد ملك حسين بن ملك علي التبريزي المجاز من الشيخ البهائي .
۲ ـ الأربعون حديثا في الأخلاق
كتبه باسم شاه طهماسب الصفوي ، ذكر أوّلاً فضل رواية الأربعين ، وأنّه ممّا بلغ عليه الثواب ، فجمع هذا في الأخلاق الممدوحة والمذمومة والأفعال الحسنة والقبيحة .
وطبع بتحقيق علي أوسط ناطقي في مجموعة ميراث حديث شيعه المجلّد الثاني (ص۱۳۵ ـ ۱۸۴) في قم سنة ۱۴۲۰ ه .
۳ ـ إصلاح جامع البين من فوائد الشرحين
بعد أن ألّف العلاّمة الحلّي كتاب تهذيب طريق الوصول إلى علم الأُصول ، قام بشرحه كلٌّ من الأخوين الأعرجيّين : السيّد عميد الدين والسيّد ضياء الدين ، ابني أُخت العلاّمة الحلّي ، وقد جمع الشهيد الأوّل الشرحين في كتاب وزاد عليهما ، وسمّاه : جامع البين من فوائد الشرحين .
وعن كتاب كشف الحجب : أنّ الشهيد ألّف هذا الكتاب في أوائل شبابه ، ولم يراجع المسوّدة ؛ لذلك بقيت النسخة غير منقّحة ، فوجدها المترجم له وأصلحها سنة (۹۴۱ ه ) جامعا فيها كلا الشرحين وزيادة الشهيد .