۴۴. تسلیک الأذهان الی إحکام الإیمان (فقه)؛ نسخه خطی آن یافت نشده است.

۴۵. تسلیک الأفهام فی معرفة الأحکام (فقه)؛ نسخه خطی آن یافت نشده است.

۴۶. تسلیک النفس إلی حضیرة القدس (کلام)؛ نسخ خطی متعددی از آن موجود و شناخته شده است.

۴۷. التعلیم الثانی (هم‌چنین: التعلیم التامّ) (فلسفه)؛ نسخه خطی آن یافت نشده است.

۴۸. تلخیص المرام فی معرفة الأحکام (فقه)؛ نسخ خطی متعددی از آن موجود و شناخته شده است.

۴۹. التناسب بین الأشعریة و الفرق السوفسطائیة (کلام)؛ نسخه خطی آن یافت نشده است.

۵۰. تنقیح الأبحاث فی العلوم الثلاثة (فلسفه)؛ نسخه خطی آن یافت نشده است.

۵۱. تنقیح قواعد‌الدین المأخوذة عن الأئمة الطاهرین (هم‌چنین: «تنقیح قواعد‌الدین المأخوذة عن آل یاسین» و «تنقیح القواعد المأخوذة عن کتاب الدرّ و المرجان فی الأحادیث الصحاح و الحسان») (روایات)؛ نسخه خطی آن یافت نشده است.

۵۲. تهذیب النفس فی معرفة المذاهب الخمسة (فقه)؛ نسخه خطی آن یافت نشده است.

۵۳. تهذیب الوصول إلی علم الأصول (اصول الفقه)؛ نسخه چاپ‌شده آن: عبد الحسین البقال، نجف: الآداب، ۱۹۷۰م.

۵۴. جواب السؤال عن حکمة النسخ فی الأحکام الإلهیة (کلام)؛ نسخه خطی آن یافت نشده است.

۵۵. جواهر المطالب فی فضائل أمیرالمؤمنین علی بن ابی طالب (در مناقب امام علی [علیه السلام])؛ نسخه خطی آن یافت نشده است.

۳۳. إیضاح مخالفة السنة (روایات)؛ نسخ خطی متعددی از آن موجود و شناخته شده است.

۳۴. إیضاح المعضِلات من شرح الإشارات (فلسفه)؛ نسخه خطی آن یافت نشده است.

۳۵. إیضاح المقاصد فی شرح حکمة عین القواعد (فلسفه)؛ نسخه چاپ‌شده آن: ع. منزوی، تهران: ۱۳۷۸ق/۱۹۵۹م.

۳۶. الباب الحادی عشَر فیما یجب علی عامّة المکلّفین من معرفة أصول‌الدین (که فصل یازدهم از شماره ۱۱۰ در همین فهرست است) (کلام)؛ نسخه‌ای از آن به همراه این شرح‌ها چاپ شده: «المقداد السُیُوری، النافع یوم الحشر»؛ و «ابو الفتح بن مخدوم الحسینی، مفتاح الباب، تحقیق مهدی محقق،  [سلسله] دانش ایرانی، ش. ۳۸، تهران: ۱۳۶۵ق/۱۹۸۶م». ترجمه انگلیسی:

۳۷. بسط الإشارات (فلسفه)؛ نسخه خطی آن یافت نشده است.

۳۸. بسط الکافیة (نحو)؛ نسخه خطی آن یافت نشده است.

۳۹. تبصرة المتعلّمین فی أحکام‌الدین (فقه)؛ نسخه چاپ‌شده آن: تهران: المکتبة الإسلامیة، ۱۳۷۲ش.

۴۰. تحریر الأبحاث فی معرفة العلوم الثلاثة (فلسفه)؛ نسخه خطی آن یافت نشده است.

۴۱. تحریر الأحکام الشرعیة علی مذهب الإمامیة (فقه)؛ نسخه چاپ‌شده آن: تهران: ۱۳۱۴ق/۱۸۹۶م.

۴۲. تحصیل الملخص (فلسفه)؛ نسخه خطی آن یافت نشده است.

۴۳. تذکرة الفقهاء علی تلخیص فتاوی العلماء (فقه)؛ نسخه چاپ‌شده آن: تهران: المکتبة المرتضویة، تهران، ۱۹۸۴م. (بازنشرِ نسخه‌ای که در سال ۱۳۸۸/۱۹۶۸ چاپ شده بود).