محمد جعفر (قرن ۱۱ق)
به: محمد باقر بن زين العابدين يزدى۵۵۸۶
محمد جعفر (قرن ۱۲ق)
السفينة (اجازة جماعة من العلماء)۶۱۷۵
محمد، جلال الدين
از: محمد بن حسين عاملى، بهاء الدين (شيخ بهايى) (م ۱۰۳۰ق)۵۵۵۰و۵۵۵۱
محمد جواد بلاغى
به: محمد هادى بن سيد جعفر بن سيد احمد حسينى ميلانى۵۹۹۸
محمد جواد بن محمد تقى ملا كتاب نجفى (م ۱۲۶۴ق)
به: محمد حسين بن محمد اسماعيل يزدى۵۷۷۹
به: محمد رضا بن محمد باقر تبريزى۵۸۲۴
محمد جواد بن محمد حسينى عاملى (صاحب مفتاح الكرامة) (م ۱۲۲۶ق)
به: ابو طالب۵۰۷۷
به: عبد الوهاب بن محمد على قزوينى (رسالة فى الاجازه)۵۴۰۵
به: محمد على بن محمد باقر مازندرانى هزار جريبى۵۹۰۳
محمد جواد صافى گلپايگانى (م ۱۳۷۸ق)
به: آيت الله شهاب الدين بن محمود مرعشى نجفى۶۲۸۰
از: نور الله بن محمد باقر نجفى اصفهانى (م ۱۳۳۶ق)۵۷۶۰
محمد جولانى همدانى (م ۱۳۶۱ق)
به: آيت الله شهاب الدين بن محمود مرعشى نجفى۶۲۸۰
محمد جيلى
از: محمد باقر بن محمد تقى مجلسى، علامه (م ۱۱۱۰ق)۵۷۶۱و۵۷۶۲و۵۷۶۳
محمد حجت كوهكمرى (م ۱۳۷۲ق)
به: آيت الله شهاب الدين بن محمود مرعشى نجفى۶۲۸۰

محمد جعفر اصفهانى
از: محمد باقر بن محمد تقى مجلسى، علامه (م ۱۱۱۰ق)۵۷۵۱
محمد جعفر بن سليمان بن محمد تقى دشت بياضى قائنى
از: محمد باقر بن محمد تقى مجلسى، علامه (م ۱۱۱۰ق)۵۷۵۲
محمد جعفر بن سيف الدين شريعتمدار استر آبادى (م ۱۲۶۳ق)
به: عباس قمى۵۳۱۴
از: على بن محمد على طباطبايى، سيد، صاحب رياض (م ۱۲۳۱ق)۵۷۵۳
محمد جعفر بن عبد الله كمره اى اصفهانى (م ۱۱۱۵ق)
به: امير عالم كرمانى۵۱۴۲
محمد جعفر بن محمد باقر استرآبادى
از: محمد باقر بن محمد حسين حسينى استرآبادى (مير داماد) (م ۱۰۴۰ق)۵۷۵۴
محمد جعفر بن محمد صادق خطيب كاشانى
از: محمد باقر بن محمد تقى مجلسى، علامه (م ۱۱۱۰ق)۵۷۵۵
محمد جعفر بن محمد صفى فارسى آباده اى (م ۱۲۸۰ق)
به: محمد نبى بن احمد تويسركانى۵۹۹۲
به: محمد رضا خراسانى۵۸۳۰
محمد جعفر بن محمد على بهبهانى كرمانشاهى
از: جعفر بن خضر جناجى نجفى، كاشف الغطاء (م ۱۲۲۸ق)۵۷۵۶
محمد جعفر بن محمد قاسم نراقى
از: پدرش محمد قاسم نراقى (زنده در ۱۲۵۶ق)۵۷۵۸
از: على بن محمد على طباطبايى، سيد، صاحب رياض (م ۱۲۳۱ق)۵۹۳۱
از: محمد حسن بن محمد باقر نجفى (صاحب جواهر الكلام) (م ۱۲۶۶ق)۵۷۵۷
محمد جعفر بن محمد كاظم طالقانى
از: محمد باقر بن محمد تقى مجلسى، علامه (م ۱۱۱۰ق)۵۷۵۹